هناك عدة أسباب تسبب القذف المتأخر من بينها أسباب جسدية و أخرى نفسية فمن بين الأسباب الجسدية نذكر مرض السكري الذي يؤثر على الاعصاب المسؤولة عن القذف كما يسبب القذف المتأخر التصلب المتعدد و إصابة العمود الفقري و الحبل الشوكي
كما يمكن أن تسبب بعض الأدوية في القذف المتأخر من بينها أدوية الأمراض النفسية و أدوية تضخم البروستات أو الأدوية التي تؤدي للانتصاب أو في حالة استئصال البروستات
أما الأسباب النفسية للقذف المتأخر فيمكن أن تكون غضبا داخليا لدى الرجل لم يعبر به للزوجة أو خوف الرجل و خجل الزوجة